2000年6月，由湘阴县人民政府批准建立湘阴县横岭湖鸟类和湿地自然保护区(县级)，2003年晋级为省级自然保护区。2006年6月，由湘阴县人民政府批准设立湘阴县林业局横岭湖自然保护区管理分局。2020年3月，由中共湘阴县委、湘阴县人民政府批准设立湘阴县横岭湖省级自然保护区管理委员会，专门负责横岭湖省级自然保护区的保护管理工作。